研究的机会
医学院学生的研究机会
赌博平台医学院的学生有机会与位于布朗斯维尔的实验室的STDOI研究人员一起工作, 爱丁堡, 和圣安东尼奥. 医学院学生目前有机会参加的项目如下.
偶尔, 短期(八至十周), 入门级的研究助理职位,以协助资助的项目. 请查看 人力资源网站 这些职位的空缺情况.
干细胞实验室(库马尔和布兰杰罗实验室,爱丁堡)
人类遗传学系的干细胞生物学实验室位于赌博平台爱丁堡校区 体外 人类遗传疾病的细胞模型,以了解涉及疾病风险的细胞和分子机制以及影响疾病表型的潜在遗传成分. 该实验室使用最先进的诱导多能干细胞(iPSC)技术来产生疾病特异性靶细胞,这些细胞的组织很难在没有侵入性手术的情况下获得,或者只有在死后才能获得.
许多STDOI研究项目集中于常见复杂疾病遗传学和利用大型家庭研究的基因鉴定. The Department of Human Genetics has a large repository of blood derived immortalized cell lines (lymphoblastoid cell lines) established from > 2000 participants of its San Antonio Mexican American Family Studies (SAMAFS). 内部开发的无转基因整合方法用于将这些人类血液来源的细胞系重新编程为iPSCs 体外 疾病模型.
2020年夏季可容纳两名学生. 根据疾病兴趣领域和实验室正在进行的研究项目,有几种不同的项目选择. 研究项目通常包括湿实验室和干实验室的组成部分,但可以仅仅是湿实验室或干实验室(分析现有的研究数据).
- 湿实验室工作的机会包括细胞重编程和分化的介绍和基本训练, 基于细胞的疾病建模, 使用荧光和亮场显微镜进行深层细胞表型分析, 流式细胞术和高含量筛选, 和DNA, 使用候选基因和全基因组方法进行RNA和蛋白质分析.
- 干实验室工作的机会包括候选基因或全基因组DNA和RNA序列数据的比对和分析, 包括全基因组基因表达数据. In-silico 候选基因的功能注释分析. 定量细胞表型、基因组和基因型数据的统计分析.
联系萨蒂什·库马尔博士.D., at satish.kumar@e-sportscast.net
Curran和Blangero实验室
复杂疾病的遗传分析
自1991年以来,STDOI的研究人员一直在领导对墨西哥裔美国人的长期研究,这些人属于来自圣安东尼奥的非常大的扩展谱系. 在研究过程中,收集了大量的表型和基因组数据. 与该项目相关的表型信息主要与心血管疾病相关, 糖尿病和肥胖, 以及大脑结构和功能.
2018年夏天,三名学生可以在STDOI-Brownsville住宿. 根据对疾病感兴趣的领域,有几种不同的项目选择. 研究项目可以仅仅是湿实验室, 仅从事干法实验室(分析)或干法实验室和湿法实验室的综合工作.
- 湿实验室工作的机会涉及人类分子遗传分析的几个方面,包括从人类血液样本中提取DNA和RNA等任务, DNA序列变异的基因分型(低通量和高通量), DNA和RNA的测序, 以及人类血浆样本的表型分析.
- 干实验室工作的机会包括与统计遗传分析小组的成员合作,使用最先进的STDOI计算资源分析遗传和表型数据, 包括一个11,000处理器计算机集群, 还有软件, 太阳能, 它是由STDOI的研究人员在内部开发的,现在被全球5000多名用户用于分析遗传数据.
博士联系. 乔安妮·柯伦报道 乔安妮.curran@e-sportscast.net
门实验室
复杂疾病的遗传和转化流行病学研究
作为STDOI的一部分, 我们的研究小组一直参与复杂疾病的遗传研究,如2型糖尿病, 肥胖, 心脏病, 糖尿病并发症, 胆囊疾病, 代谢综合征, 儿童肥胖及其心脏代谢相关, 黑棘皮症, 出生体重和成年疾病, 早产, 艾滋病毒和虫媒病毒感染. 这些研究的主要目标是确定遗传和环境因素及其相互作用对特定复杂性状变异的影响. 重要的是, 我们一直在使用先进的分子, 组学, 统计, 和统计基因技术来定位, 识别和功能表征导致对特定疾病易感性或与疾病相关的特定数量性状变异的遗传变异或生物标志物.
- 湿实验室工作的机会包括介绍和使用以下实验室技术:从人类血液样本中提取DNA和RNA, 定量rt - pcr, 基因分型, DNA凝胶电泳, 西方墨点法, 细胞培养, 细胞分化, 多参数流式细胞术.
- 机会 for dry-lab work include clinical epidemiology design; application of mathematical models to health; univariate and multivariate 统计 analysis; 统计 genetic analyses to analyze genetic and phenotypic data obtained from family- and population-based studies; and bioinformatics. 一些计算机程序,比如太阳能, SPSS和Excel将用于执行统计和统计遗传分析. 全基因组基因表达数据集分析方面的培训(例如.g.(RNA-Seq)也可用.
2018年夏季,三到六名学生将被安置在stdoi - edinburgh的EREBL实验室. 可用的导师包括博士. Ravi Duggirala, Chris Jenkinson, Srinivas Mummidi,校长Arya和Juan Carlos Alvarenga.
博士联系. 克里斯·詹金森 克里斯多夫.jenkinson@e-sportscast.net